Пивоты должны быть в мировом нуле нуле.. попробуйте объеденить статику в одну модель, вставить ей пивот в 0 и проэкспортить.
Когда пивоты сидят в середине модели, а эта середина смещена относительно мирового нуля, это смещение может при экспорте добавиться к смещению модели, ибо пивот Макса при экспорте пропадает и экспортер считает, локальным нклем модели мировой.
При этом, экспортер все же читает смещение Максового пивота и добавляет модели это смещение.
В результате, модель в движке получает пивот 0 и сама смещается относительно 0 на смещение максового пивота
Как вариант, проверьте, есть ли у моделей в Юне смещение в трансформах и обнулите их. Но, думаю, это геморное занятие.
Как костыль, можете пивоты всех моделей сбросить в мировой 0 в Максе и экспортнуть. Проблема исчезнет. Правда, это костыль и так делать нехорошо