Что я сделал...
Я делал легче. Открывается моно, и тут же, сразу надо менять раскладку на английский язык (то есть еще до того как начал писать код или еще чего). Тогда ctrl+с и другие будут работать в обоих языках. Если не работает, закрывать моно, снова открывать и снова менять раскладку. Если и сейчас не работает, закрывать юнити и начинать заново.
Кстати, тут советовали поставить старый моно, но у меня такая проблема и там. Вообще странно вроде юнити пользуются миллионы людей, для монодевелопа это огромный пиар, а зделать нормальное переключение раскалдок чтобы оно работало на локализованных виндах (ведь наверняка проблема не только с русским языком), они до сих пор не смогли...
Люди, а юнитекам об этом баге писали? Потому что это кажется проблема из-за самой юнити. Я бы сам написал - но не знаю как.