waruiyume писал(а):Проблема в том, что ссылка находится в рантайме, причём видимо код вызывается у инстансе префаба, а не у префаба.
ну тут как бы вопрос был в том что может ли скрипт на префабе ссылаться на другие объекты, ответ - может. Это я немножко придрался к словам.
если ставить вопрос что он работает и вызывается только если находится в сцене - то да, получается скрипт вызывается у инстанса префаба.